1、水垢導熱性很差，會導致受熱面傳熱情況惡化，從而浪費燃料或電力。

2、水垢如果附著在熱力設備受熱面上時都將危及熱力設備的安全、經濟運行。因為水垢的導熱性很差，妨礙傳熱。使爐管從火焰側吸收的熱量不能很好地傳遞給水，爐管冷卻受到影響，這樣壁溫升高，造成爐管鼓包，引起爆管 。

3、水垢膠結時，也常常會附著大量重金屬離子，如果該容器用于盛裝飲用水，會有重金屬離子過多溶于飲水的風險。

4、水垢碎片進入胃中會與鹽酸反應，釋放出鈣鎂離子和二氧化碳，前者是結石形成的必要物質。后者則會使人脹氣、難受，胃潰瘍病人還可能發生胃穿孔的危險。